Az elsődleges tünetek közé tartoznak az akaratlan izomösszerándulások (tic-ek), az izomgörcsök (elsősorban a lábszárgörcs), a stressz és az idegesség, illetve a szívritmuszavarok és a szapora szívverés. Hangulatváltozások, álmatlanság, migrén, izomgörcsök, hányás és hányinger, remegés, étvágytalanság, zavartság, szívritmuszavarok egyaránt szerepelhetnek a hiánytünetek között. A magnézium tartósan csökkent bevitele mellett fokozott fáradékonyság, idegrendszeri problémák és anyagcsere-zavarok léphetnek fel, romlik a vérkeringés. Romlik a fizikai és a szellemi teljesítmény, gyengül a memória, általános gyengeség is jelentkezhet.
Hosszú távon megnő az oszteoporózis (csontritkulás), az inzulinrezisztencia és a diabétesz (cukorbetegség) , a hipertónia (magas vérnyomás), a szívinfarktus és a sztrók (szélhüdés) kockázata. A magnézium kapcsolatban áll a szervezet egyéb elektrolitjainak egyensúlyával, így ha az egyikből hiányt szenvedünk, előbb-utóbb a többiből sem jut elég a szertvezetnek.24, 25